UME

Biyoanaliz Laboratuvarı

Hakkımızda

TÜBİTAK UME Biyoanaliz Laboratuvarı, ulusal ve uluslararası düzeyde biyometroloji alanına giren endüstriyel, yasal ve bilimsel faaliyetlerin doğru ve güvenilir şekilde yürütülmesi için ilgili kurum ve kuruluşlarla iş birlikleri kurar, destek sağlar ve gerekli çalışmaları gerçekleştirir.

Faaliyet Alanları ve Hizmetler

Nükleik Asit Çalışma Grubu

Laboratuvar, DNA ve RNA analizlerinde yüksek doğruluk ve düşük belirsizlikle ölçümler gerçekleştirir. Çalışma konuları arasında:

Tarım ürünlerinde genetiği değiştirilmiş organizmaların (GDO) miktarının dijital PZT (dPCR) yöntemiyle belirlenmesi
Et ve jelatinde tür tayini (dana, domuz, at, deve, koyun, keçi, tavuk, ördek, somon)
Helal belgelendirme analizleri için referans malzeme üretimi ve yeterlilik testleri
Kanserli dokularda ve sıvı biyopsi örneklerinde DNA mutasyonlarının, metillenmiş DNA miktarının ve RNA transkript düzeylerinin belirlenmesi

Bu çalışmalar, gıda güvenliği, helal sertifikasyonu ve genetik analiz alanlarında önemli referans ölçümler sunar.

Protein Analizleri Çalışma Grubu

Laboratuvar, proteomiks alanında LC-MS/MS, HPLC ve ELISA gibi ileri teknolojilerle yüksek doğruluklu ölçümler yapar. Çalışma konuları:

Kompleks proteom analizi ve göreceli miktar tayini (LFQ-TMT)
Protein modifikasyonlarının (metilasyon, asetilasyon, fosforilasyon vb.) tanımlanması
Peptit fragmantasyonu (HCD tabanlı)
Enzim aktivitelerinin belirlenmesi
Klinik laboratuvarlar için sertifikalı referans materyal üretimi

Bu hizmetler, kardiyovasküler hastalıklar, nörodejeneratif bozukluklar, sepsis, diyabet ve böbrek hastalıkları gibi birçok patolojinin teşhisinde kullanılan tıbbi testlerin doğruluğunu ve karşılaştırılabilirliğini artırmayı hedefler.

Hücre Temelli Araştırmalar

Laboratuvar, kök hücreler, kan hücreleri ve kanser hücreleri gibi farklı hücre türlerinin karakterizasyonu ve sayımı için yeni yöntemler geliştirir. Mikroskopi ve akış sitometrisi gibi ileri cihazlar kullanılarak hücre analizleri yapılır. Bu çalışmalar, hücresel düzeyde tanı, araştırma ve kalite kontrol süreçlerine katkı sağlar.

Sunduğu Hizmetler

Kalibrasyon / Deney Hizmetleri

Eğitim Hizmetleri

Danışmanlık Hizmetleri

Teknik Donanım ve Ekipmanlar

DNA ve RNA miktarı ölçümlerinde kullanılan temel ve ileri ölçüm sistemleri:

Referans sayısal polimeraz zincir tepkimesi (dPZT) cihazları
Gerçek zamanlı polimeraz zincirleme tepkimesi (qPZT) cihazları
Spektrofotometre ve Floresan spektrometre cihazları
Doku parçalayıcı sistemler
Santrifüjler
Etüvler ve çalkalayıcılı inkübatörler
Jel elektroforez ve görüntüleme sistemi

Peptit/Protein karakterizasyonu ve miktar ölçümlerinde kullanılan temel ve ileri çözümleme sistemleri:

Çözünürlüklü Kütle Spektrometrisi (Biopharma)
Sıvı kromotografi sistemleri
- Analitik UPLC
- Nano UPLC
- Semi-prep
- FPLC
Amino Asit Analiz Hidroliz ve Derivatizasyon Çalışma İstasyonu
96 kuyucuklu plaka okuyucu
2D protein jel elektroforezi sistemi
Ultrasantrifüj
Off-gel fraksiyonlama sistemi

Hücre kültürü çalışmaları için gerekli temel ve ileri çözümleme sistemleri:

Akış sitometresi
Floresan mikroskobu

KİMYA GRUBU

Projeler ve İş Birlikleri

TÜBİTAK UME İç Destekli Ulusal Referans Malzeme Üretim Projeleri

Et Tür Tayini Sertifikalı Referans Malzeme Üretimi, 2019-2022

Bağlantı: https://rm.ume.tubitak.gov.tr/urun_grup.aspx?p=c/TGjTV95zFUKxnNjTyVoA==

Klinik Analizler için Peptit/Protein Yapılı Sertifikalı Referans Malzeme Üretimi: C-Reaktif Protein, 2018-2021

Bağlantı: https://rm.ume.tubitak.gov.tr/urun.aspx?u=8Nlv/fToQ0+bXx6VTfcR5A==

Bağlantı: https://link.springer.com/article/10.1007/s00769-023-01563-w

Hemoglobin A1c Sertifikalı Referans Malzeme Üretimi, 2016-2020

Bağlantı:

Et Tür Tayini Referans Malzemesi Üretimi, 2015-2017

Bağlantı: https://rm.ume.tubitak.gov.tr/urun_grup.aspx?p=c/TGjTV95zFUKxnNjTyVoA==

Virüs Yayılımını Azaltma Projesi (VirYAP), 2020-2021

Bağlantı:

Dış Destekli Projeler

TÜBİTAK İkili İşbirliği: Klinik Bağlamda Kardiyak Troponinin Biyolojik Değişkenlerinin Ölçüm Üzerindeki Etkisi, 2024-Devam Ediyor

Bağlantı:

EPDK: Akaryakıtlar için Ulusal Marker Sisteminin Geliştirilmesi ve Sürekli Güncellenmesi, 2011-Devam ediyor

Bağlantı:

Doğu Marmara Kalkınma Ajansı TR42/20/COVID/0035: 2019-nCoV Virüsünün Hızlı ve Güvenilir Şekilde Teşhisine Yönelik Tanı Kiti Referans Malzemesi Üretilmesi, 06.2020 - 09.2020

Bağlantı: https://rm.ume.tubitak.gov.tr/urun.aspx?u=PwTB/Yp33LeNUTHGqy/xAw==

Bağlantı: https://rm.ume.tubitak.gov.tr/urun.aspx?u=9UtZ95Xrnh7XQpqS5FfBAA==

TÜBİTAK İkili İş Birliği: Türkiye–Güney Kore İşbirliği ile Gen Metilasyon Ölçümleri için Uluslararası Standart Sistem Geliştirilmesi, 2016-2017

Proje, TÜBİTAK destekli yurtdışı ortaklı ikili araştırma projesidir. Türkiye ve Güney Kore metroloji enstitülerinin işbirliği ile gen metilasyon ölçümleri için uluslararası standart ölçüm sisteminin geliştirilmesi amaçlanmaktadır. Gen ölçümleri kanserin erken teşhisinde kullanılmaya başlanmıştır. (Tamamlandı)

TÜBİTAK 1001: Tüberküloz Tanısı İçin Biyosensörlerde Kullanılabilecek Aptamer Geliştirilmesi, 2010-2012

Tüberküloz tanısının daha hızlı ve hastane dışında yapılmasında kullanılmak üzere üretilecek biyosensörlerde kullanılabilecek aptamer geliştirilmesi amaçlanmıştır. (Tamamlandı)

Bağlantı: https://doi.org/10.1007/s12010-015-1913-7

TÜBİTAK 1001: Transplantasyon Öncesi Kullanılan Karaciğer ve Böbrek Koruma Solüsyonlarının Proteomik Analizi, 2010-2013

Organ transplantasyon koruma sıvıları transplantasyon öncesi organları muhafaza etmek icin kullanılmakta ve bu süreç boyunca organlardan koruma sıvısına, enzim, protein gibi birçok molekül geçişi olmaktadır. Bu projede böbrek ve karaciğerden koruma sıvısına geçen proteinler iki farklı yöntemle incelenmektedir; iki boyutlu jel elektroforezi (2-DE)-MALDI-TOF çalışmaları TÜBİTAK UME, LC-MS/MS çalışmaları ise TÜBİTAK MAM GMBE (Gen Mühendisliği ve Biyoteknoloji Enstitüsü) tarafından yürütülmektedir. (Tamamlandı)

Bağlantı: https://doi.org/10.2174/1570164615666180905104543

Bağlantı: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0168755

Tarım Bakanlığı: Ürün Takip Sistemi Geliştirilmesi Fizibilite Projesi, 2009-2011

Bağlantı:

Avrupa Birliği Metroloji Enstitüleri Araştırma Projeleri

EMPIR 23FUN06 ProMET: Ölçülen Büyüklüklerin, Analitik Hedeflerin Ve Bunlarla İlişkili Ölçüm Belirsizliğinin Tanımını Destekleyen Temel Protein Metrolojisi (2024-Devam Ediyor)

Bağlantı: https://www.euramet.org/research-innovation/search-research-projects/details/project/fundamental-protein-metrology-to-support-the-definition-of-measurands-analytical-targets-and-their-associated-measurement-uncertainty

EMPIR 23IND02 CoMet: IVD Testlerinin Standardizasyonu Ve Piyasaya Sürülme Sonrası Gözetimi İçin Uyumlu Kalibratörlerin Ve Kalite Kontrol Malzemelerinin üretimi (2024-Devam Ediyor)

Bağlantı: https://www.euramet.org/research-innovation/search-research-projects/details/project/manufacturing-of-commutable-calibrators-and-quality-control-materials-for-standardisation-and-post-market-surveillance-of-ivd-tests

EMPIR 22HLT07 NeuroBioStand: Nörodejeneratif hastalıkların biyobeliteçlerinin ölçümlerinin standartlaştırılması (2023-Devam ediyor)

Bağlantı: https://www.euramet.org/research-innovation/search-research-projects/details/project/standardisation-of-measurements-of-neurodegenerative-disease-biomarkers

EMPIR 22HLT06 GenomeMet: Erken Kanser Teşhisi ve Hassas Tıpta Genom Profillemesi için metroloji (2023-Devam Ediyor)

Bağlantı: https://www.euramet.org/research-innovation/search-research-projects/details/project/metrology-for-genomic-profiling-to-support-early-cancer-detection-and-precision-medicine

EMPIR 18HLT10 CardioMet: Koroner kalp hastalıklarının biyobelirteçleri için nicel tanı yöntemlerinin geliştirilmesi, 2020-2023

Bağlantı: https://www.euramet.org/research-innovation/search-research-projects/details/project/providing-the-measurement-infrastructure-to-allow-quantitative-diagnostic-methods-for-biomarkers-of/

Bağlantı: https://clinicalproteomicsjournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12014-023-09430-z

EMPIR 18NET02 TraceLabMed: Avrupa Klinik Laboratuvarın İzlenebilirliği Ağı Desteği, 2019-2024

Bağlantı: https://www.euramet.org/research-innovation/search-research-projects/details/project/support-for-a-european-metrology-network-on-traceability-in-laboratory-medicine

EMPIR 15HLT07 AntiMicroResist: Mikrop direncinin belirlenmesi, SI izlenebilir takibi ve değerlendirilmesi için yeni malzemeler ve metotlar, 2016-2019

Bağlantı: